Не только ссылаться. Но и "собирать" (от слов fetch, gather) единые по смыслу (семантике) компоненты текста. Допустим, как я уже говорил, так работает автоматическая проверка полноты описания компонентов в user manual. Т.е. автоматически собираются все guiitem и потом сравнивается с существующим списком. Если чего-то нет - присылается письмо или CI/CD сваливается со статусом failed. Но опять же, это имеет смысл в больших (даже огромных) массивах текстов по схожей тематике. Т.е. это уровень корпорацией, а не небольших компаний. P.S. Кстати, многие компании поменьше, у которых был DocBook и которые захотели перейти от редактирования в XML редакторе к редактированию "в чем угодно" перешли именно на adoc, а не markdown. Например, компания Neo Technology (разработчик Neo4j).
ИМХО (чисто ИМХО) маркдаун - это баловство :)