Вообще, по-нормальному приложения надо через AIDE собирать, чтобы получилось именно приложение, а не просто исполняемый файл, но у нас там свой скрипт, приходится через Termux ещё генерировать CMakeLists или скрипты для ndk-build (но я пока до ещё не добрался до того, чтобы это всё подключать к приложению, и пока использую обычный GNU make), ну или даже можно вообще через терминал собирать .so, а потом их использовать при сборке APK