Size: a a a

2021 April 01
Darth Biology
Если вам (не)понравилось, есть пожелания/предложения/критика, пишите всё в @db_feedbot. А пока опрос:
источник
Darth Biology
Делаем ли ещё эфиры?
Анонимный опрос
85%
Да
15%
Нет
Проголосовало: 336
источник
2021 April 25
Darth Biology
Друзья. Мы продолжаем борьбу за право заниматься просвещением.
Выкатили проект подзаконного акта к закону о просвещении, который уже приняли. И там все гораздо бредовей, чем кажется.
Попадают, как и ожидалось все, даже мы, блогеры.
В проекте дичь вроде:
- обязательного заключения договоров с научными, образовательными и культурными учреждениями.
- ценза на занятия просветительской деятельностью по возрасту (18+), по стажу (больше двух лет, как они это будут считать?), по всякой другой дури.

В общем, я советую неравнодушным пройти по ссылке ниже и высказать свое фи этому проекту.
Да. Мы все устали. И иногда опускаются руки. Но если мы ничего не сделаем, то гайки будут закручивать ещё больше...
источник
Darth Biology
В общем-то лично у меня есть площадка, с которой я заключила договор. Но лекции там, понятное дело, платные, трансляций нет (есть только видеокурсы), ну и в целом это создаст кучу проблем. Особенно мне интересно, как можно набрать два года опыта просветительской деятельности, если ей можно заниматься только тем, у кого есть опыт, а опыт можно набрать, только занимаясь просветительской деятельностью, а заниматься ей нельзя... Ну вы поняли.
источник
2021 May 25
Darth Biology
Если вам кажется, что у вас есть обсессивно-компульсивное расстройство, потому что вы часто моете руки, не наступаете на линии на плитке, а ещё вы самый главный перфекционист на районе, то, вероятнее всего, это видео для вас.

https://youtu.be/ri0YIhtPBmM

Далее цитата из российских клинических рекомендаций по ОКР:

Обсессии – это повторяющиеся или неотвязные мысли, представления, или побуждения. Обсессии не приносят удовольствия и не воспринимаются как произвольные. Они назойливые, нежелательные, и большинство людей страдают или испытывают тревогу от их появления. Пациенты с ОКР стараются игнорировать, избегать, подавлять навязчивости, или нейтрализовать их другими мыслями или действиями (например, выполняя ритуалы).

Компульсии (ритуалы) – это повторяющееся поведение или идеаторные акты, которые человек совершает из чувства необходимости в связи с содержанием обсессий или в соответствии с правилами, требующими точности исполнения, или достижения чувства «завершенности», «полноты» выполнения. Целью является уменьшение дистресса, вызванного обсессиями, или предотвращение нежелательных событий. При этом компульсии никаким реалистичным образом не связаны с этими «опасными» событиями или очевидно избыточны в сравнении с обычными действиями. Компульсии также могут выполняться для избавления от чувства «незавершенности» — например, необходимость многократного повторения действия, пока оно не будет выполнено «абсолютно правильно». Выполнение ритуалов не приносит удовольствия, хотя некоторые пациенты испытывают облегчение тревоги и дискомфорта.
Обсессии – это повторяющиеся или неотвязные мысли, представления, или побуждения. Обсессии не приносят удовольствия и не воспринимаются как произвольные. Они назойливые, нежелательные, и большинство людей страдают или испытывают тревогу от их появления. Пациенты с ОКР стараются игнорировать, избегать, подавлять навязчивости, или нейтрализовать их другими мыслями или действиями (например, выполняя ритуалы).

Компульсии (ритуалы) – это повторяющееся поведение или идеаторные акты, которые человек совершает из чувства необходимости в связи с содержанием обсессий или в соответствии с правилами, требующими точности исполнения, или достижения чувства «завершенности», «полноты» выполнения. Целью является уменьшение дистресса, вызванного обсессиями, или предотвращение нежелательных событий. При этом компульсии никаким реалистичным образом не связаны с этими «опасными» событиями или очевидно избыточны в сравнении с обычными действиями. Компульсии также могут выполняться для избавления от чувства «незавершенности» — например, необходимость многократного повторения действия, пока оно не будет выполнено «абсолютно правильно». Выполнение ритуалов не приносит удовольствия, хотя некоторые пациенты испытывают облегчение тревоги и дискомфорта.

Если у вас есть какие-то симптомы, пожалуйста, обратитесь к врачу. А вот искать в каждом своём действии симптомы ОКР и пытаться вылечиться самостоятельно с помощью «надо просто превозмочь» не стоит.
источник
2021 May 31
Darth Biology
Столько всего произошло за последнюю неделю! Пока я нахожусь в режиме ожидания новой статьи о происхождении вируса SARS-CoV-2, о которой написали, что интересно, в первую очередь не журнал "Природа" или журнал "Генетика", а газета DailyMail, учёные успели опубликовать препринт крайне важной статьи на bioRxiv.

Но для начала немного контекста.

Проект Геном человека — это глобальное международное исследование, которое начало планироваться ещё в 80-х годах прошлого века. В 2000-2001 гг. были опубликованы черновые варианты, а уже в 2003 году сообщалось об опубликовании полной структуры человеческого генома. Казалось бы, проект завершён, однако на самом деле это было не так. Дело в том, что устройство человеческого генома слишком сложно, поэтому, несмотря на усилия множества учёных по всему миру, многие участки оставались нерасшифрованными.

27 мая была опубликована новая сборка T2T-CHM13, в которую включены данные по остававшимся 8% последовательности генома человека (анализ данных проводился при использовании гаплоидной клеточной линии CHM13hTERT). К слову, среди авторов статьи есть и исследователи из России: из СПбГУ, Университета Сириус в Сочи, Института общей генетики им. Н.И. Вавилова, МГУ, а также Федерального ИЦ "Фундаментальные основы биотехнологии".

Таким образом, учёные наконец смогли закрыть восьмипроцентный гештальт пробел в знаниях о человеческом геноме. Viva la science!
источник
2021 June 04
Darth Biology
История одного успеха
источник
Darth Biology
источник
Darth Biology
источник
Darth Biology
источник
Darth Biology
источник
Darth Biology
источник
Darth Biology
источник
2021 June 15
Darth Biology
Повторение, как говорится, мать мученья ученья. 19 июня в обеденное время (время уточняется) иммунолог Дарья Карташева-Эберц и один из разработчиков вакцины Спутник V Владимир Гущин проведут прямой эфир в Инстаграме Дарьи. Коллеги ответят на самые популярные и горячие вопросы о вакцине. Если вы не слушали наши эфиры из ClubHouse, не хотите читать конспекты, а может у вас есть какой-то новый вопрос, это мероприятие специально для вас.

Ну и вдогонку — выпуск подкаста Эффект Наблюдателя с Владимиром.

➜ Apple Podcasts
Google Podcasts
Яндекс Музыка
Другие платформы
Слушать на сайте
источник
2021 June 16
Darth Biology
⚡️Российский фонд прямых инвестиций (РФПИ) рассчитывает, что вакцина от коронавируса "Спутник V" может получить регистрацию Европейского агентства лекарственных средств (ЕМА) в течение двух месяцев.

В заявлении РФПИ отмечается, что "все данные о клинических испытаниях "Спутника V" были предоставлены, инспекция GCP (good clinical practice, надлежащая клиническая практика) завершена и по ее результатам от ЕМА был получен позитивный отзыв".
источник
Darth Biology
Data science — это не только "модное" направление в науке, но ещё и набор весьма полезных для биологии и медицины инструментов и методов. Со мной связалось неформальное сообщество специалистов @sberloga. Оказывается, они там регулярно организуют мероприятия, связанные с data science, в том числе на стыке с биоинформатикой, а мы с вами про это и не знаем!

Завтра в 19:00 по Москве состоится очередной доклад Анвара Курмукова (Сбер Институт Искусственного Интеллекта, ВШЭ, ИППИ) на тему "Проблемы Deep learning/Computer Vision при анализе медицинских изображений". В докладе будут рассмотрены ключевые проблемы, с которыми приходится бороться при построении алгоритмов автоматической разметки, связанные с особенностями:
- данных (малые размеры выборок, трехмерность, множество различных источников данных и др.);
- формулировок задач (сегментация, локализация/key points, классификация);
- клинических требований (устойчивость к доменным сдвигам, консистентность/интерпретируемость предсказаний и др.).

Также всех интересующихся приглашают вступить в сообщество по интересам @sberlogabio
YouTube
Валерий Хаменя, Михаил Косарецкий - Машинное обучение и анализ мутаций SNP
Неформальный семинар-обсуждение. Мутации SNP (cнипы) это простейшие замены одного нуклеотида на другой в ДНК. Их может быть очень много - 300 тысяч или более дорогие технологии измеряют 80 миллионов "снипов". Обсуждаем использование техники машинного обучения анализа зависимостей мутаций. Очевидно, лобовое вычисление даже 300 тысяч на 300 тысяч корреляций идея не очень реалистичная и разумная, не говоря уже о 80м на 80м. Задача максимум - попытаться построить графовую нейронную сеть, чтобы извлекать биологически интересную информацию из подобных данных, возможно, обогащенных дополнительными фичами.  Доступные данные, например:  https://kaggle.com/ilfiore/genome-data-of-a-khazar-origin

📝 Материалы:
https://drive.google.com/file/d/19rcOXEZqqyA6Yp0KdO9rhuLl0cNZFjyN/view?usp=sharing

📢 Подписывайся на наше сообщество в telegram, чтобы быть в курсе мероприятий: https://t.me/sberloga

🗨 Обсудить доклады по биоинформатики можно в нашем чатике https://t.me/sberlogabio
источник
2021 June 17
Darth Biology
Суперважное популярное видео о депрессии. Осторожно, в видео есть весьма неоднозначные комментарии

https://youtu.be/qh8wghUzMOM

Напоминаю, что эффективность психоанализа регулярно критикуется
YouTube
Грусть, тоска, печаль: как распознать и победить депрессию? / Редакция
Заказать газовые грили от Weber: https://bit.ly/3q06y3j

По данным Института психологии РАН, каждый третий россиянин в 2020 году жаловался на ту или иную форму депрессии.

В этом выпуске мы решили ответить на все неудобные вопросы об этом заболевании (а это именно болезнь, а не хандра, как многие считают).

Как она возникает? Нужно ли её лечить? Помогают ли антидепрессанты? А психологи? И сколько стоит эта помощь?

И вообще, как отличить плохое настроение от состояния, с которым нужно бороться?

***
За помощь в организации съёмок благодарим бар «Котельная»: http://depolesnaya.ru/bars/kotelnaya

***
Станьте спонсором «Редакции»:
https://www.youtube.com/channel/UC1eFXmJNkjITxPFWTy6RsWg/join

Мерч «Редакции»: https://mamcupy.com/catalog/redaktsiya/

Подписывайтесь на наши социальные сети:

Телеграм-канал «Редакции»:
https://t.me/redakciya_channel

Инстаграм Алексея:
https://www.instagram.com/pivo_varov

ТикТок Алексея и «Редакции»: https://vm.tiktok.com/ZSgd7NJp/

Редакция в «ВК»:
https://vk.com/redakciya_pivovarova…
источник
2021 June 20
Darth Biology
С учётом какого-то кошмара, происходящего в последние дни, думаю, важно обозначить:

1. Антитела перед прививкой от COVID-19 и после неё проверять не надо. Это лично ваше желание, это совсем не обязательно, результаты ничего не значат. Если вас в частной лаборатории уговаривают сдать анализы на уровень антител перед вакцинацией, знайте, что вам просто хотят сделать доппродажу.

2. Пороговые значения нейтрализующих антител, обеспечивающие стерильный иммунитет, пока неизвестны. Обещают скоро официальную информацию, пока всё на уровне слухов.

3. Опубликованных данных об эффективности Спутника V против дельта-штамма («индийского») пока нет. Обещали публикацию, вчера на стриме один из разработчиков сообщил об эффективности Спутника V против этого штамма на уровне 85%. Пока нет статьи, исключительно ваше дело, верить ли этому заявлению.

4. Покупка липовых сертификатов о вакцинации — это не просто уголовная ответственность. Это ещё и дискредитация вакцинации. Представим себе ситуацию: человек с липовым сертификатом попадает в больницу, не признаёт подделку (ведь это уголовная ответственность), врачи рапортуют о том, что вакцинированный заболел/лежит на ИВЛ/в крайне тяжелом состоянии/умер. Насколько сложно будет потом объяснить людям, что вакцина эффективна? Всего один такой случай может отвернуть от вакцинации тысячи сомневающихся и подарит новый аргумент тем, кто против вакцинации. Кампания по вакцинации, и без того двигавшаяся черепашьим шагом, окончательно загнётся.

5. Если вас отказываются прививать после перенесённого COVID-19, вы имеете полное право подать жалобы в Минздрав, Роспотребнадзор и Комитет по здравоохранению.

6. Ждать вакцину Pfizer/Moderna/J&J/у моря погоды, будем честны, на данный момент не имеет смысла. Я очень люблю новые технологии и при первой возможности ревакцинируюсь Pfizer. Но никаких предпосылок к появлению иных вакцин в РФ, кроме российских, сейчас, увы, нет. Ожидание может сильно затянуться, как итог — растущая заболеваемость.

7. Теперь блиц:
🟢Критика статей — это нормально.
🟢Редактирование статей после публикации — тоже.
🟡Ответы на критику — это тоже нормально, но почему-то менее освещаемо.
🟡Вопросы с Бразилией и Словакией урегулированы (но почему-то опять же не освещались в СМИ на том же уровне, как само появление этих проблем).
🔴Когда будет одобрение ЕМА, точно неизвестно, всё на уровне слухов.
🔴За подачу документов и соблюдение дедлайнов отвечает не только и не столько НИИ Гамалеи, сколько РФПИ.
🔴Много претензий не к качеству вакцины, а к качеству представления данных. Если бы все умели представлять данные как надо, в конце концов, сидеть бы мне без работы.

С надеждой ждём ответов на все возникающие технические вопросы, новых публикаций по Спутнику V и хорошей публикации в международном журнале по вакцине КовиВак.
источник
2021 June 23
Darth Biology
К слову о случаях смерти от COVID-19 среди вакцинировавшихся. Инстаграм взрывает новость о главвраче одной из подмосковных больниц, который недавно умер от коронавирусной инфекции. Врач призывал прививаться, публично вакцинировался сам.

Не могу сказать точно, сколько правды в этой истории. Одно точно: прогноз о том, что кампания по вакцинации будет терпеть всё новые удары с каждой историей о том, что кто-то заболел или умер после вакцинации, к сожалению, сбывается. Очень жаль, что истории с негативным опытом так быстро расходятся.

Историй с положительным опытом обычно мало: если человек привился, с ним всё нормально, ну так и где здесь новость? Это понятно. Но есть ещё и другой момент: многие люди вполне обоснованно полагают, что частные случаи не могут служить аргументацией. В связи с этим у меня к вам небольшой вопрос.
источник
Darth Biology
Нужны ли в информационном пространстве истории о положительном опыте вакцинации?
Анонимный опрос
66%
Да, я бы почитал (-а)
13%
Да, я бы поделился (-ась)
17%
Нет, будем последовательны, частный пример не аргумент
5%
Нет (иная причина)
Проголосовало: 619
источник