не совсем онтологии, но knowledge graphs используют для разбора пользовательских запросов и далее построения запросов в search engine во многих e-commerce поисковых системах, это помогает строить более точные запросы и разрешать неоднозначности (и я бы это не относил это к "интеллектуальным агентам", т.к. в тех же диалоговых агентах есть и другие применения, хотя да, это в чем-то смежные области)
хотя последнее время из-за хайпа в NLP/DL многие эксперементируют с semantic search по векторам чтобы жить без knowledge graphs и тп, но пока что это хорошо заходит только для некоторых видов запросов и плохо работает с текущими популярными search движками (вроде solr и elasticsearch)
ну вот это ровно наша история, вектора отлично работают для узких, целевых запросов, но для широких нужны все равно онтологии (или knowledge graphs)