раз заказчик наотрез отказывается жить вне ворда, значит с вероятностью около 100% часть исправлений будет втихаря без комментариев.
Т.е. вам всё равно нужен механизм сравнить, построить дельту от того, что ему выслали и вернули обратно.
Плюс гарантированно у вас будет не туда-сюда-туда-сюда, а ветвление. Люди, живущие в ворде, неизбежно сваливаются в бардак ветвления версий этого ворда.
Ну и да, вам нужен человек, разгребать этот бардак. Если на работе с госзаказчиком нет маржи столько, чтобы окупить этого человека, то большой вопрос, зачем это нужно