Я в дизайнере их пакую). В пейнтер вроде не умеет с такими работать
сабстенц должен уметь, я видел такой пример в кс го, там типа 1 текстуру с разными подвидами делают(устаревающими текстурами) и потом продают одну пушку с пятью шкурками от самой новой до очень старой