ИМХО использование классических методов не исключает использование глубоких моделей и, наоборот, - методы могут работать вместе, последовательно, в ансабмле, например препроцессинг классикой, а потом в нейронку вторым уровнем, или получение фичей нейронкой, а сами фичи вторым уровнем в простую модель. Также может быть так что для глубокой модели не достаточно данных и остается только вариант донейронных cv методов. В медицине, возможно, просто не могут доверять полностью нейронкам, когда эффективность cv-алгоритмов доказана более строго