базы должны запускаться на виртуальных машинах, которые и так дают свой оверхед. Добавлять к ним ещё оверхед докера потому что это "удобно-модно-молодёжно" очень странно.
Если база обслуживает mission-critical сервис компании (а не заббикс, без метрик которого можно и пожить часок) лишние слои абстракции только вредят.
Как же так, спросите вы, говорит про лишние слои, а сам при этом загоняет про виртуалки. Только видимо при этом не учитываете, что виртуалки живут на много-террабайтных файловых хранилищах подключенные через 10гбит-аплинки, с репликацией в соседний датацентр и live-миграцией между сотнями серверов :)