Думаю, ваши проблемы могут решиться покупкой мыши со своим USB-донглом и отдельного bluetooth-адаптера подключаемого по usb (стоит нагуглить совместимые с linux). Но сначала лучше погуглить конкретно по вашему встроенному bluetooth модулю и выяснить, можно ли его завести под линуксом. Во всех дистрибутивах будет один и то же пакет для работы c bluetooth -
http://www.bluez.org/ - довольно кривая и нестабильно работающая штука, к сожалению