Size: a a a

R language and Statistical data analysis

2020 April 20

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
Объясните зависимые и независимые метрики исследования
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
Опыт - контроль - наличие и отсутствие какого-то химического агента?
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
А от него зависит наличие или отсутствие таких-то белков?
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
Stanislav Kurpe
Наверное необходимо дать больше информации)

Определяли белки в опыте и контроле.  Общие белки обязательно должны быть, потому что они  эксперссируются постоянно.
Тут наблюдение - это пробирка с бациллой, а не белок
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
и что меряется?
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
Уровни экспрессии белков - фичи.
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
это вообще не нарушение независимости. От того, что одинаковые белки содержатся в разных пробирках, они никак друг на друга не влияют.
источник

DP

Dmitry Penzar in R language and Statistical data analysis
Александр Райков
Так и не предлагается же z-критерий делать, а именно Стьюдента t
У стьюдента предположение о нормальность генеральной совокупности
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
№_пробирки белок_1 белок_2 ... белок_n
1 0 0 ... 0.12
2 0.23 0 ... 0
такое что-то
источник

DP

Dmitry Penzar in R language and Statistical data analysis
Dmitry Penzar
У стьюдента предположение о нормальность генеральной совокупности
Если ее нет - то 30 наблюдений никак не влияют на его применимость. А вот z-тест можно использовать за счет того, что уже среднее сходится.
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
Александр Райков
это вообще не нарушение независимости. От того, что одинаковые белки содержатся в разных пробирках, они никак друг на друга не влияют.
если пробирок всего 2, то имеем 2 выборки по 1 наблюдению
источник

DP

Dmitry Penzar in R language and Statistical data analysis
+
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
так что Стьюденты пока отдыхают
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
Andrey
если пробирок всего 2, то имеем 2 выборки по 1 наблюдению
Ну да. Что вообще не подлежит статистической проверке. А сколько там пробирок?
источник

DP

Dmitry Penzar in R language and Statistical data analysis
Andrey
так что Стьюденты пока отдыхают
Это к другому вопросу было. Тут хиквадрат хотели, что тоже нет
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
Александр Райков
Ну да. Что вообще не подлежит статистической проверке. А сколько там пробирок?
автор вопроса пока не признается
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
Dmitry Penzar
У стьюдента предположение о нормальность генеральной совокупности
Да. Но во многих ситуациях оно выдвигается априорно, пока не доказано обратного
источник

DP

Dmitry Penzar in R language and Statistical data analysis
Andrey
автор вопроса пока не признается
Но можно обрезать белки по порогу и дальше анализировать семейства, куда они входят. Тогда статистику навернуть получится, но другого рода.

Вроде честно ответил, две пробирки.
источник

АР

Александр Райков in R language and Statistical data analysis
Dmitry Penzar
Если ее нет - то 30 наблюдений никак не влияют на его применимость. А вот z-тест можно использовать за счет того, что уже среднее сходится.
Если его нет, то 30 наблюдений уже позволяют оценить нормальность Лиллиефорсом или Шапиро-Уилком. Про z-тест вообще не понял в этой ситуации. Что к чему здесь сходится?
источник

A

Andrey in R language and Statistical data analysis
Dmitry Penzar
Но можно обрезать белки по порогу и дальше анализировать семейства, куда они входят. Тогда статистику навернуть получится, но другого рода.

Вроде честно ответил, две пробирки.
вот если бы пробирки оказались 96-луночными плашками... Или 384-луночными :)
источник