I
А так вообще можно?
Думаю что вполне. Например лекарство не подействовало
Size: a a a
2020 April 20
ЕТ
Ian
Думаю что вполне. Например лекарство не подействовало
Так это третья группа незапланированная получается. И нельзя же просто сказать, что "лекарство не подействовало", это не так работает...
I
Так это третья группа незапланированная получается. И нельзя же просто сказать, что "лекарство не подействовало", это не так работает...
Тогда может быть будет иметь смысл пропустить эти значения?
ЕТ
Ian
Тогда может быть будет иметь смысл пропустить эти значения?
+
ЕТ
Хотя, нет, вряд ли.
R
Игнорировать то, что лекарство не действует в половине случаев, было бы странно, мягко говоря :D
SK
Это негодный дизайн эксперимента
Наверное необходимо дать больше информации)
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
SK
Я просто немного не понимаю, как определить где граница между опытом и контролем, одинаковы они или нет
ВН
Там тоже как-то не всё гладко. Скорее всего я заморачивался ради одинаковых разделителей для дробной части между R / Excel / Google Spreadsheets. Но сейчас меня больше волнует, что это, на что системная локаль влияет в R.
Умю меня стояла полностью англоязычная версия винды и R, но потом пришлось менять локаль вмнды и дотягивать кириличные символы, кажется. Насколько я помню был какой-то прикол с отсутствием возможности выбора Windows - 1251
DP
Stanislav Kurpe
Наверное необходимо дать больше информации)
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
И сколько опытов и контролей? Или одын, везде одын?
SK
И сколько опытов и контролей? Или одын, везде одын?
Два😔
DP
я бы GO-обогащение посмотрел. И прочим. Сервисами типо DAVID и тд. А на этом просто так статистику хз как делать...(
SK
я бы GO-обогащение посмотрел. И прочим. Сервисами типо DAVID и тд. А на этом просто так статистику хз как делать...(
Спасибо
АК
dplyr-cli
https://coolbutuseless.github.io/2020/04/20/manipulate-csv-files-on-the-command-line-with-dplyr-cli/
cat mtcars.csv | group_by cyl | summarise "mpg = mean(mpg)" | kable
#> | cyl| mpg|
#> |---:|--------:|
#> | 4| 26.66364|
#> | 6| 19.74286|
#> | 8| 15.10000|
https://coolbutuseless.github.io/2020/04/20/manipulate-csv-files-on-the-command-line-with-dplyr-cli/
a
dplyr-cli
https://coolbutuseless.github.io/2020/04/20/manipulate-csv-files-on-the-command-line-with-dplyr-cli/
cat mtcars.csv | group_by cyl | summarise "mpg = mean(mpg)" | kable
#> | cyl| mpg|
#> |---:|--------:|
#> | 4| 26.66364|
#> | 6| 19.74286|
#> | 8| 15.10000|
https://coolbutuseless.github.io/2020/04/20/manipulate-csv-files-on-the-command-line-with-dplyr-cli/
красиво
AS
красиво
Название сайта говорит само за себя =)
АР
Stanislav Kurpe
Наверное необходимо дать больше информации)
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
Определяли белки в опыте и контроле. Общие белки обязательно должны быть, потому что они эксперссируются постоянно.
Хи-квадрат точно подразумевает независимость наблюдений. А что вы с ним хотели проверять?
АР
там вообще говоря разница есть еще на 30 (t и z)
Так и не предлагается же z-критерий делать, а именно Стьюдента t
АР
Если есть веские основания предполагать нормальность, то Стьюдента можно хоть на 4 делать
SK
Хи-квадрат точно подразумевает независимость наблюдений. А что вы с ним хотели проверять?
Ну я не знаю насколько у меня опыт независим от контроля . По крайней мере, бактерии были в разных пробирках)
Я думал не на словах показать, что уже на количестве обнаруженных белков наблюдается отличие опыта от контроля
Я думал не на словах показать, что уже на количестве обнаруженных белков наблюдается отличие опыта от контроля