По обычаю делового оборота отчуждение исключительного права подразумевает передачу исходников. Если договором предусмотрите, что они не передаются, значит, не передаются. Сочинять про "лишение права" на модификацию не надо. Хочет приобретатель модифицировать — пусть декомпилирует или правит бинарники напрямую. )
А из чего следует, что передача исходника – это обычай? Ну то есть практика по исходникам она очень разная в контексте сделки с отчуждением. Я бы сказал, что исходники скорее наоборот чаще не передают, чем передают. Если в софте есть код стороннего продукта, то как на него может быть передан исходник, если скажем, это прямо запрещено условиями лицензии стороннего продукта?
Но я согласен с тезисом (по крайней мере, с формальной точки зрения), что если в договоре обязательство передать исходники не сформулировано, то такого обязательства и не существует. Вообще ответ на вопрос «обязан ли передавать исходники» во многом зависит о того, как сформулирован договор. Просто если в нем вообще нет никаких положений относительно передачи чего-то ещё кроме исключительного права, то так можно и сам продукт не передать. В законе (по крайней мере, в российском) в этом смысле, к слову говоря, очевидный пробел.
Ну т.е. гипотетически, создала команда продукт, заключен договор отчуждения, оплата по нему поступила, исполнитель её принял, права по акту передал, а продукт (почему-то), уничтожил. И все, в законе прямого ответа, что делать в таком случае, нет.
Более менее это расписано в 1288 (про обязанность передать материальный носитель, хотя исходник, переданный файлом – это вроде как не совсем передача материального носителя). Если уж что-то и применять по аналогии, то вот эту статью (в российских опять же реалиях). С машиной пример не очень хороший, потому что по такой логике (аналогии) исходники передавать обязательно (в рамках российской юрисдикции – это статья 135 ГК РФ – про ключи и машину)
Я кроме того соглашусь и с тем, что с точки зрения чистой юриспруденции наличие/отсутствие исходников никак не влияет на объем правомочий, приобретенных в рамках сделки по отчуждению. Т.е. да, физически исполнить отдельные операции с продуктом будет сложнее (или даже в каких-то случаях, невозможно), но это никак не противоречит предмету отчуждения (право на переработку – оно так сформулировано в 1270, никто не отнимает в отсутствие исходников).