Никто не хочет коммит сделать? 😊

код бенчмарка хочу малость поправить. Остальное до выходных смотреть не буду. Думать надо.

👍

Кстати, в каком-то обсуждении был вопрос, а как BioJulia текст парсит.
Не знаю, используют ли они до сих пор этот пакет, но в их репозитории есть вот такая штука: https://github.com/BioJulia/Automa.jl

По сути ребята берут регулярку и из неё строят конечный автомат, который (метапрограммирование!) превращается просто в обычный джулия код.
При этом у них есть опция unroll, когда они уменьшают количество циклов за счёт построения более развесистого if дерева.

В результате в некоторых бенчмарках они в несколько раз обгоняют встроенный парсер регулярок.
Ну и за счёт того, что это конечный автомат, они цепляют действия на состояния и получают мощный текст процессор.

СерьезнаЯ задачка для отличников по теории автоматов..

Да, как-то не ожидаешь такого  от биологов.

К примеру книжка по генетике состоит минимум на 50% из матана и теорвер. В общем биологи может и не очень фундаментальными знаниями обладаю, но практическими не хуже чем сами математики)))

Один из курсов на Курсере по алгоритмам — по биоинформатике

https://github.com/JuliaLang/PackageCompiler.jl

в версии 1.0 полностью переделали процедуру компиляции своих пакетов
Более того, появился раздел https://julialang.github.io/PackageCompiler.jl/dev/devdocs/relocatable_part_3/#man-tutorial-reloc-1

Хммм....
А он вообще рабочий?
Я никогда не пользовался, но на дискурсе в основном обсуждают почему-то PackageCompilerX

Я так понял, что он в более активной разработке.

был условно рабочим. У меня на одном из наших пакетов проявлялся баг. Сегодня пинганули проверить. А оно всё изменилось 🤔

по крайней мере, у меня было несколько сервисов, которые компилировались. Создавался образ, довольно быстро запускался. Другое дело, что размер образа был под полгига

This repository has been archived by the owner. It is now read-only.

The content of this package is merged into https://github.com/JuliaLang/PackageCompiler.jl. Issues and PRs should go towards that repo.

PackageCompilerX и стал новым поколением PackageCompiler

А! Да, тогда все логично.
Всё-таки надо будет попробовать как-нибудь им воспользоваться.

В Julia как проще работать с битовыми массивами? Случай когда в памяти не помещается. Массив трёхмерный

Есть вроде класс BitArray, не подходит?

Если задача позволяет, то можно считывать массив по кусочкам и обрабатывать. Где-то был такой тип массивов.