А чем не понравился предложенный ранее вариант — использовать разные символы для выделения заголовков в основном и подчиненном файлах? Мне кажется, в промышленном масштабе — это не удобно, но проблему должно решить (если, конечно, нет необходимости вставки на том же уровне)