я примерно также делаю, у нас только продукт один, но много модулей. Делаю папку docs (репозиторий для всех доков), в ней папка, например, project _name_1 , с нашим главным проектом, дальше проекты можно будет добавлять как 1,2,3 и т.д. это на случай расширения наших продуктов, и уже в папке project _name_1, разбивка на модули, mod1, mod2 и т.д. По редми от разработчиков, решил его не подтягивать, будет бардак.