А если, рассмотреть такой вариант? Вы в соответствии с ГОСТ 24.602 (если я правильно понял), планируете работы в несколько этапов, утверждаете, планируете расходы и т.д. На 1 этапе проектируете АСУ ТП с описанием критических процессов, как требует 127ПП и выполнение требований пп. 10 и 5(на всякий случай). В ФСТЭК пишете письмо, что вам для категорирования кровь из носу нужно получить исходные данные для категорирования и т.д. Согласуете со ФСТЭК свой порядок. Второй этап будет заключаться в проектировании подсистемы безопасности на основании Исх. данных, полученных на этапе 1. В ФСТЭК. рекомендую написать не меньше 3 писем - три ответные отписки от них(хотя могут и согласовать, чем черт не шутит) прикроют Ваш тыл. )) Как Вам такой подход?