Хорошо. Вы заявили, что делали разные разработчики, хотя делал и Desktop и нативную версию тот же разработчик, разве что разные подразделения, возможно.
Да, два клиента, два разработчика
Telegram Desktop (сейчас Telegram Lite) разрабатывает John Preston
Telegram for macOS (Нативный) разрабатывает другой человек Mihail Filimonov (есть в этом чате - Мишк)
Далее, первый клиент, это QT мультиплатформенный клиент для Windows, Linux и macOS, второй же делается только для macOS (он и есть нативный клиент)