Даже если заметно сбросить мощность, то сигнал от фотодиода будет сложно поймать, особенно с учетом внешней засветки. Так что я просто стараюсь меньше светить лазером, когда не надо.
Поиск краем платы идет вообще не без проблем - появился край, лазер автоматом выключается, так что фоторезист не засвечивается, а если и засветился - то он там, действительно, мусорный.
Вот сканирование реперных отверстий - тут фоторезист вокруг отверстия в зоне сканирования полностью засвечивается, на фотках по моей ссылке выше это видно.
Реперные отверстия можно вынести за пределы платы, или поставить их на земляной полигон.