Вопрос: конфа из гита будет сильно отличаться от аналогичной из хранилища? по всяким служебным полям, тем же обычным формам?
При сравнении/объединении
Тут какой вопрос: в Конфигураторе и cf хранится много мусора (старое состояние, невычещенные изменения, кэши, что-то "прозапас" и так далее...) поэтому, если конфа не типовая из тех что выпускаяются на EDT (которые всё это безобразие уже вычистили у себя) - то, да, сначала лучше произвести чистку мусора, чтобы при сравнении было меньше расхождений...
Обычные формы - в EDT не поддерживаются. И вроде как они будут туда-сюда гоняться без изменений... но не проверял на практике.