NR
У флинка есть некоторое количество уже реализованных за пользователя дополнительных функций, которых нет у кстримов, но их с тем же успехом можно реализовать и в стримах.
В то же время разработка на стримах, сугубо на мой взгляд, намного проще просто потому, что кстримы - библиотека и, разрабатывая приложение на них, в итоге получается готовое самостоятельное приложение, которое не обязано быть запущенным на кластере. Однако в этом случае теряется некоторый контроль над ресурсами.
Чего у кстримов нет, но, опять-таки можно реализовать, так это механизма чтения данных откуда-либо еще, кроме как кафки. У флинка все это есть из коробки и есть возможность добавлять новые источники/таргеты.