Если цель сохранить данные из топика А в топик Б и промежуточная обработка несложная и самих данных немного, то кафка стримы норм. Если что-то сложнее фильтрации, аля аггрегаты или джоины, и данных достаточно много, то, как минимум, из-за того, что флинк не будет плодить кучу промежуточных топиков, в отличие от кафка стримов, флинк чуть более предпочтительные будет.
+ флинк на кластере развернут => есть контроль над ресурсами