Суть проблемы: мне прислали список айдишников (с дублями и пустыми ячейками). Я, как белый человек, прочитал это в R, удалил дубли и пустые ячейки, сджойнился с другими данными, сохранил в Excel и подумал, что задача решена. Но не тут-то было.
Как выяснилось, сджойниться нужно было ровно так же, как это делает Excel: "пропуски к пропускам, дубли к дублям", т.е. чтобы порядок и кол-во строк были идентичными тому, что приходит во входящем файле.