Не уверен, что это можно сделать из RN, но можно залезть чуть-чуть в нейтив и либо вызвать штуку из первого ответа, либо выставить primaryColor, как сказано во втором
Из вариантов на уровне бреда, если они научились в zIndex, то можно положить первым слоем полигон и менять его цвет. А уже над полигоном гонять маркеры