Да им как-то до одного места, они выкатят тебе претензию, что на их системе не работает и будешь ты как электровеник летать, если изначально не заявил о требованиях к окружению
Если приложение гуевое, то да, астра сидит на Qt. Если консольное - то не факт, без fly-wm qt может отсутствовать. Дальнейшие вопросы по астре предлагаю в тематический чатег: @astralinux_chat
Скажем, если Astra Linux пишет на Qt 4, а ты разрабатываешь для Qt 5 - то не получится распронять свое приложение без предустановки Qt 5 runtime. Вообщем, твоя версия Qt должна быть согласована с версией Qt, входящей в дистрибутив Astra Linux.
https://wiki.qt.io/Qt_5.15_Release , обрати внимание на Changelog-и и New features, вот New features - это как раз список того, что будет работать в одной версии и не будет работать в предыдущей