Видите ли, выбор инструмента напрямую влияет на ответ на этот вопрос. Есть подходы, при которых ТК дублируются и живут пользовательскими сценариями по папочкам.
Есть те, где разложены по функциональностям.
Есть инструменты, типа аллюра, где можно сложить тк в кучу, а потом по фильтрам и тегам сохдать нужный прогон.