И что из этого? если разные таблицы то не проблема. Если одну и ту же таблицу разные колонки то тоже ничего страшного, а если два разраба в разных коммитах меняют одну и ту же колонку в одной и той же таблице, то с процессом разработки уже все плохо и порядок миграций скорее всего не основная проблема в проекте