А при чем тут гуй/не гуй... Тебе нужно "упаковать" ноду и твой код в одно исполняемое приложение. Электрон с этим вполне справляется. Просто сделай гуй в формате трея и все.
так там все описано как использвовать, проблема потом в логировании вот у меня будет испольняемый файл, если будет ошибки, как потом их логировать, чтобы понимать в каком месте ошибка