я делал бота для телеги. сейчас уже не уверен, но раньше мне казалось, что он сделан вполне в духе чистой архитектуры.
https://github.com/pongo/fatmotorbotслои:
* юзкейсы (т.е. бизнес-логика)
* контроллеры (обрабатывают команды из телеги, вызывают юзкейсы)
* инфрастуктура (репозитории бд, обертка над апи телеги)
слои не соответствуют папкам, если что.