Две самые плохие штуки это:
То что ты подолгу сфокусирован на одном расстоянии — Это и спазм аккомодации, и сухие глаза, потому что при концентрации мы моргаем почти в двое реже. И это относится длительному чтению книг и прочаяя подобная работа.
Второе это яркость монитора. Если окружение темное или просто недостаточно яркое, в глаз чаще попадает больше света чем должно быть исходя из окружения, проблемы адаптации. И как Рома писал, ритмы нарушаются. Тут стараться не работать ночью, использовать яркость поменьше, темные темы, и прочие примочки.