Ну, это проблема сети либо клиента. Сервер тут ни при чём.

получается сети :/

тспдампы?

поэтапно идут к тспдампу) но поэтапно

Да он двух концов друг с другом свести не может, чё там у него происходит — ваще не ясно.
А ты TCP dump...

Ну блин, проблема не в mysql, и не в клиенте, и не с ос

Конечно. Проблемы в головах!

ну логов на голову точно Я не найду

поэтому однозначно сказать не смогу

Значит проблемы нет.

ну, а что еще получается, как еще проверить, если не tcp?

ладно мне надоело.

:c

Ну проверяй TCP, чё!
Ты ж птица сильная, ты ж птица гордая!

А какие еще есть варианты? :/

Я вроде всё рассказал уже.

Ну такой вывод

а какие варианты насчет сети, если не tcp?

Ещё раз для тех кто в танке.

0) Aborted connection 31 to db: 'db' user: 'user' host: 'localhost' (Got an error reading communication packets) — это не ошибка, и ничего плохого в этом нет. Сервер просто сообщает , что клиент отвалился и он закрыл соединение.
1) ЕСЛИ других ошибок в логе сервера нет, то всё ок, беспокоиться не о чем.
2) Почему там у тебя отваливается клиент и почему он не работает — дело десятое, к этому никак не привязано.