Если какие-то кэши не сбрасываются сами, то это почти наверняка баг. Если есть хоть какое-то репро, то можно репортить в
kotli.in/issue. Типичный репро багов инкрементальной компиляции выглядит как-то так: “взять вот этот проект, открыть, сбилдить, поменять вот в этом файле эту строчку, сбилдить еще раз, увидеть проблему”. Если изменения очень большие и тяжело минимизировать (например, если ИК ломается при чекауте между ветками), можно просто две версии проекта/две ревизии в gitе присылать