Подозреваю, что ещё одна из причин скорости R функций в том, что на сишном бекенде поддерживается достаточно мало типов в реальности. Несколько форматов чисел (что-нибудь типа Int/Float) и строки факторизованные. В этом смысле структуры данных достаточно жёстко типизированы, это позволяет многие вещи упрощать (писать type stable функции говоря джулиевским языком).
В этом одна из проблем DataFrames, что они пытаются быть достаточно гибкими (в рамках системы типов Джулии) и поэтому чем-то приходится жертвовать.
