Поиск вхождений точки в одномерном отрезке сведётся к бинарному поиску по двум координатам, но это ещё надо будет отрезки так сложить - а это + сложность, + сложность поддержки этого индекса.
Суммарно не вижу, чтобы в худшем случае задача решалась проще, чем простой перебор