Не важно, какой паспорт, учитывается вся история поездок, даже транзит.
Если страна транзита вдруг окажется "красной" или пассажир был в "красной зоне" в течение последних 10 дней, туристу откажут во въезде.
Россия в оранжевой зоне. Израиль - в зеленой.
Если вы все 10 дней были в оранжевой зоне, то соблюдаете правила оранжевой.
Если вы живете в Израиле и полетите транзитом через РФ, например, то все равно должны соблюдать оранжевые правила.