core - логика фреймворка, общие компоненты для cli и десктопа. Туда все, что для каждого проекта
common - логика класса приложений. Например, десктопное приложение имеет окно с настройками, там логика этого окна
domain - все что касается специфической логики приложения. Для rss читалки это rss, фиды и т.п.
Сейчас сделаю дамп проекта rss-читалки на ди