В этой сцене Артур и Брюс очень похожи и даже одеты в похожую одежду. Вероятно, этим режиссер пытался подчеркнуть их родство. Более того, в последующей ссоре Артура с Томасом тоже можно найти много сходств между ними. Я... допускаю, что они действительно родственники. И что Артур Флек действительно сын Томаса Уэйна, что бы там нибыло написано в официальных документах, которые Артур крадет из больницы. Важно понимать - в бумаги написать можно что угодно, их можно подделать имея средства. Но вот внешность и родство подделать нельзя. Я думаю именно это хочет нам сказать режиссер. Так что да, Джокер и Бетмен единокровные братья.
Более того. Я думаю это Томас Уэйн избивал Артура в детстве. Именно он, а не какой-то "любовник Пенни", виновен в его травме.