т.е если делать просто скалирование по оси Х и У то оно вытягивает из вдоль осей, а когда через эпплай включаешь ротейт то оно их вытягивает вдоль осей
кого вытягивает? если ты применяешь ротацию, то оно обнуляет только ротацию объекта, это никак не имеет отношения к масштабу или трансформации (если мы о блендере)