Смотря какие. Пока самый корень может существовать долго, а внутри него может крутится уже совсем другое. И эти объекты, которые содержать внутри себя ссылки друг на друга могут быть уже не нужны, но существуют пока есть корень, хотя оно могло быть убито уже, потому что ни используется ни где после.
Если внутри него крутится уже другое - то и доступны из корня они не будут. Потому что ни на один из объектов ссылки мы не держим. А если мы их держим в другом потоке - значит они доступны из корня того, другого потока, и если мы там ссылку удалим - сборщик точно так же их соберет без всяких проблем. Ничем от прямой ссылки циклические тут не отличаются. Точно так же можно передать прямую ссылку, на активити например, в другой поток и точно такую же утечку мы получим.