никак не могу вспомнить как решал эту проблему ранее.
поменял файловую систему на разделе с f2fs на btrfs. имеется контейнер (папка с ос), который запускается через systemd-nspawn.
соответственно, окромя смены фс изменений в папку с ос, которая используется для контейнера nspanw не вносились.
при попытке запуска в запущенном контейнере команды из под рут через sudo выдаёт ошибку
sudo: effective uid is not 0, is /usr/bin/sudo on a file system with the 'nosuid' option set or an NFS file system without root privileges?