По моему, все зависит от целей учёта. Если мне необходимо отследить баланс взаиморасчётов с организацией, то учитываю через долги.
В случае с бензином, мне важнее знать, сколько я реально трачу на него, а компенсацию заводил бы доходом по той же категории. Ведь если у другого работодателя нет компенсации (всякое бывает) - важнее знать реальные расходы.