Оцените ответ от yarkov. Если вдруг кому актуально, то я решил проблему так.
В корне проекта создаём файл app.html. Именно он будет браться за основной темплейт:



 
   
     html,
     body {
       font-family: "Montserrat", Helvetica, Arial, Verdana, Tahoma, sans-serif !important;
     }
   
   {{ HEAD }}
 
 
   {{ APP }}
   {% if (ENV.NODE_ENV === 'production') { %}
     
     
       (function(m, e, t, r, i, k, a) {
           m[i] = m[i] || function() {
               (m[i].a = m[i].a || []).push(arguments)
           };
           m[i].l = 1 * new Date();
           k = e.createElement(t), a = e.getElementsByTagName(t)[0], k.async = 1, k.src = r, a.parentNode.insertBefore(k, a)
       })
       (window, document, "script", "https://mc.yandex.ru/metrika/tag.js", "ym");

       ym(66856768, "init", {
           clickmap: true,
           trackLinks: true,
           accurateTrackBounce: true,
           webvisor: true
       });