Исходный текст, распознаваемый Алисой - без знаков препинания.
Перед отображением текста на дисплее, знаки препинания в нём предсказываются машиннообученной моделью.
А в навык подаётся только исходный текст, увы.
Запятые можно предсказать самостоятельно.
Вот пример готовой модели, но она довольно тяжеловесная, а профит от знаков препинания сомнительный, поэтому лично я бы не рекомендовал с этим заморачиваться.