Да, все так, и при первом рублевом поступлении вы можете создать в разделе "Валютные операции" сделку и учитывать все рублевые платежи от Upwork в ней, чтобы не пропустить момент, когда нужно будет ставить на учет, так как сделка умеет считать общую сумму