Я вот думаю, что если теперь все пропуски заполнить нулями, то это наверное не сильно поможет, потому что мы заведомо не предсказываем на недели, где истинный таргет равен нулю, поэтому и модели знать о нулях не за чем. Даже не уверен, поможет ли это сделать точнее скользящее среднее.