Хотя я нашёл некоторый костыль. После загрузки нужно удалить оттуда в папке бинари питон и руби и скинуть туда новые версии скачанные. Так же с гитхаба новые версии инструментов скачать и установить (обновив зависимости). Но это полумеры, они улучшили опыт использования, но не решили все проблемы.
Хотя я нашёл некоторый костыль. После загрузки нужно удалить оттуда в папке бинари питон и руби и скинуть туда новые версии скачанные. Так же с гитхаба новые версии инструментов скачать и установить (обновив зависимости). Но это полумеры, они улучшили опыт использования, но не решили все проблемы.