Начиная с systemd 232 (выпущенного в 2017 году) вы можете редактировать /etc/systemd/resolved.confи добавлять эту строку:
DNSStubListener=no
Это отключит привязку к порту 53.
Этот параметр более подробно описан на странице руководства resolved.conf .
Вы можете найти версию systemd, с которой работает ваша система:
systemctl --version