вьі хотите сказать, что небольшой кристалл на Cortex M0 без всяких ОС, RTOS и прочего, не сможет прореагировать вовремя на сигнал с акселерометра?
надо понимать, что система управления не строится "монолитно". на реддите была недавно статья о том, что за ПО использует тот же falcon 9, там четкое разделение в системе управления на аппаратную и программную. ракетой рулят там отнюдь не CPU под линуксом.