Ну в нулевом приближении варианты такие:
1. Инициализировать всех из переменных окружения. Минусы - сложно отследить что они отличаются.
2. Завести секцию в кластерном конфиге. Одинаковость гарантируется картриджем, но редактировать без кворума становится невозможно (пока мы это не починим). И гранулярноти по репликасетам не удобно добиваться.
3. Хранить настройки в спейсе и пусть сами реплицируются. Главное обвешаться тригерами чтобы конфликтов не было.