Windows Embedded Standard включает в себя компоненты Enhanced Write Filter (EWF) и File Based Write Filter (FBWF). EWF позволяет защитить системный раздел от записи и предотвратить вмешательство в работу встраиваемой системы. FBWF позволяет защитить отдельные файлы и папки и, таким образом, дает возможность оставить доступ к папкам, в которые требуется записывать файлы (например, папка для записи рекламных роликов) при этом защитить системную папку.