потому что крон джобы и таймеры системд делаются для автоматизации периодически выполняемых процессов. делать работу раз в час или раз в полчаса намного проще и понятнее в реализации, чем раз в 40 мин. необходимость в менее круглых числах все усложняет. мне было бы интересно узнать о задачах, которые кровь из носа нужно только раз в 40 мин запускать (вместо раз в 30 мин или раз в 60 мин). кроме будильников, конечно. но для полседних есть специализированные решения, более подходящие.